职能管理部门

党政办公室

纪委办公室

组织人事处

装备财务处

后勤保障处

专业管理部门

技术指导处（国家资质认定司法鉴定行业评审组秘书处）

标准化处

科研管理和成果转化处

质量管理处

培训交流处

信息中心

期刊中心

专业研究部门

法医病理学研究室

法医临床学研究室

法医毒物化学研究室

法医物证学研究室

法医精神病学研究室

文痕和微量物证鉴定研究室

声像和电子数据鉴定研究室

环境损害司法鉴定研究室

道路交通事故鉴定研究室

司法鉴定制度和文化研究室